STAGE - Mesure microbiologique des eaux potables par cytométrie de flux : bancarisation des cytogrammes et analyse statistique

Le SDEA (Syndicat des Eaux et de l’Assainissement Alsace-Moselle) est un établissement public de coopération spécialisée, créé il y a plus de 80 ans. Il fédère aujourd’hui 740 communes des départements du Bas-Rhin, du Haut-Rhin et de la Moselle, représentant plus d’un million d’habitants. 

Ses missions couvrent l’ensemble du cycle de l’eau, dans une démarche de gestion intégrée reconnue comme référence aux niveaux national et international. 

Le SDEA emploie 800 agents, exerçant 110 métiers techniques d’une grande diversité et technicité, contribuant à assurer un service public continu, 24h/24, 365 jours/an. 

L’ensemble des agents se retrouvent autour de valeurs fortes : responsabilité, sens du service public, proximité, solidarité et excellence, excellence reconnue de longue date par plusieurs certifications (ISO 9001, ISO 45001 et ISO 14001) et distinctions (Prix français de la Qualité et de la Performance). 

Ces valeurs partagées sont incarnées au quotidien par les agents, qui témoignent régulièrement de leur engagement à travers les "Mardis Découvertes", visibles sur la chaîne SDEA Alsace-Moselle - YouTube.

🌱 Engagement en faveur du développement durable 

Le SDEA est reconnu pour sa politique ambitieuse en matière de transition écologique et de protection de l’environnement, en réponse aux défis du changement climatique. Il a obtenu depuis 2008 le niveau "Exemplarité" lors des évaluations successives ISO 26000 pour son engagement en faveur du développement durable et en 2022 une reconnaissance européenne EFQM pour sa démarche d’économie circulaire de l’eau, intégrée aux 700 engagements de la Conférence mondiale de l’eau de l’ONU de 2023. 

🏛️ Gouvernance et fonctionnement 

Administré par des élus locaux issus des territoires qu’il dessert, le SDEA fonctionne selon un modèle de gouvernance fédérateur, permettant aux communes et EPCI membres :

• d’agir localement, à l’appui d’un service de proximité à moins de 30 minutes de chaque usager,

• de mutualiser leurs moyens et de bénéficier ainsi d’un haut niveau d’expertise au meilleur coût,

• et de réinvestir les gains de productivité au seul bénéfice des usagers et de l’intérêt général.

  

Une des missions principales du SDEA est d’assurer l’approvisionnement en eau potable en quantité et qualité suffisantes 365 jours/an.

Actuellement, plus de 400 sources et plus de 200 forages assurent cette alimentation sur l’ensemble du secteur d’intervention du SDEA. Leur qualité microbiologique est un enjeu majeur. Pour cela, le SDEA Alsace-Moselle s’est doté depuis quelques années d’une technologie innovante de cytomètrie de flux permettant de caractériser rapidement et précisément la composition microbienne des eaux. Ce stage s’inscrit dans une démarche visant à améliorer la compréhension et l’exploitation des données issues de cette technologie.

Objectifs du stage :

Le stage sera articulé autour de deux axes principaux :

1. Bancarisation des cytogrammes

• Collecter et organiser les cytogrammes obtenus pour différentes eaux potables.

• Mettre en place une base de données structurée permettant la conservation et la consultation des résultats en lien avec les solutions informatiques du SDEA.

• Définir les métadonnées associées (type d’eau, conditions de prélèvement, paramètres analytiques).

1. Analyse statistique des données

• Développer des méthodes d’analyse pour interpréter les cytogrammes.

• Identifier des indicateurs pertinents pour la caractérisation microbiologique.

• Proposer des visualisations et des outils statistiques pour comparer les eaux testées.

Missions principales :

• Réaliser des mesures microbiologiques par cytométrie de flux sur différents échantillons d’eau potable.

• Structurer et alimenter une base de données des cytogrammes.

• Effectuer des analyses statistiques (exploratoires et comparatives) sur les données collectées.

• Rédiger un rapport synthétique des résultats et recommandations.

• Etablir des préconisations sur les moyens et modes de traitements physiques ou chimiques à mettre en place (réservoirs, puits) en fonction des prédictions statistiquement évaluées.

Livrables attendus :

• Base de données des cytogrammes avec métadonnées associées.

• Rapport d’analyse statistique incluant indicateurs, graphiques et interprétations.

• Guide méthodologique pour la bancarisation et l’analyse des cytogrammes.

Planning prévisionnel (4 mois à 6 mois) :

• Prise en main des outils, protocole de cytométrie, collecte des premiers échantillons.

• Bancarisation des cytogrammes, structuration de la base de données.

• Développement des analyses statistiques et visualisations.

• Synthèse des résultats, rédaction du rapport et recommandations.

Profil recherché :

• Étudiant(e) en formation niveau Bac+4 ou Bac+5 en biologie, microbiologie, bioinformatique ou statistiques appliquées.

• Connaissances en microbiologie et/ou techniques de cytométrie de flux (appréciées).  Compétences en bioinformatique, informatique, bases de données, statistiques et intelligence artificielle.

• Maîtrise des outils statistiques (R, Python, ou équivalent).

• Rigueur, autonomie et capacité d’analyse.

Compétences développées :

• Manipulation et interprétation de données microbiologiques.

• Gestion et structuration de bases de données scientifiques.

• Analyse statistique et visualisation des données.

• Rédaction scientifique.

Modalités :

Période visée de stage : Avril – Octobre 2026

Durée : 4 à 6 mois

Rémunération : 669,90 € net/mois si stage > à 8 semaines et < à 24 semaines

  848,00 € brut/mois si stage > 24 semaines et forte implication et satisfaction

Contrat : Convention de stage tripartite

Lieu du stage : Siège du SDEA à Schiltigheim (67) – Au sein de l’équipe Transformation Métiers et Innovation

Maître de stage : Monsieur Emmanuel FELLMANN

Fonction : Chef de projet - Transformation Métiers et Innovation

Adresse siège du SDEA : Espace Européen de l’Entreprise, 1 rue de Rome, 67 300 Schiltigheim

https://www.sdea.fr/index.php/fr/le-sdea/rejoindre-le-sdea/les-offres